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提速近10倍 !基于深度学习 的全基因组选择新方法来了******

  近日 ,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用 ,将助力深度学习在全基因组选择中的应用 ,为智能设计育种及平台构建提供有效工具 。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上 。

  全基因组选择作为新一代育种技术 ,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体 的预测和选择 ,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程 ,节约成本 ,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测 的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间 的复杂关系。

  相较于传统模型 ,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应 的能力 ,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法 的优化将会提高全基因组选择 的预测能力 。

  该研究团队以玉米 、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法 。

  与其他五种主流预测方法相比 ,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测 ;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度 ;预测精度稳健,在小型数据集上 的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好 。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目 的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

新时代好青年如何闪亮青春******

  作者 :姚文杰、冯秀军(中央财经大学马克思主义学院)

  时代各有不同,青春一脉相承 ,无奋斗 ,不青春 。新时代呼唤何种青春奋斗,新时代青年 的奋斗又该如何开启?习近平总书记在党 的二十大报告中对广大青年“立志做有理想、敢担当 、能吃苦 、肯奋斗的新时代好青年”的寄语,蕴藏着新时代青年奋斗的内驱力 。

  “有理想”昭示奋斗目标。激发新时代青年奋斗,要回答“为什么而奋斗”的问题。目标是奋斗必不可少 的内核。奋斗就像踮起脚尖去摘果实,如果 是在一棵看不见果实 的树下盲跳,自然易生犹疑之心 ,出现躺平念头。当然 ,现实生活有很多外在压力 ,即使没有目标 ,人也无法轻易躺平。但不躺平 ,还可能走进另一种困境 ,那就是内卷。内卷和奋斗不 是一回事 ,内卷往往 是盲目的 ,因为没有目标,只能盯着别人,即使卷赢了 ,其中也有太多低效的 、无意义的消耗。因此奋斗必须知道“为什么” ,才能摆脱无方向 的内卷 ,战胜无动力的躺平 。并非任何一种目标都能给奋斗指明方向 、注入动力。几年前,大学生中出现了一种“空心病”现象。从他们 的剖白看 ,他们并不缺少目标 ,但仍因不知道何为人生的意义、奋斗 的价值而苦闷迷茫 。能够作答人生之问、价值之问的不 是具体目标本身,而是昭示目标的理想 。目标可以着眼于具体和眼下,切实可行才会不断给人正向反馈;而理想要远大,理想 是为人生定向的,不远大不足以使人看到方向,如同夜间行路 ,太近 的灯光只能照亮眼前,给不了一个人向何处去的答案 。青春蕴含强大 的拼搏能量 ,青年不能只看到一角四方的天空 ,而是要放眼天下 ,用脚步丈量祖国大地,用眼睛发现中国精神 ,用耳朵倾听人民呼声 ,用内心感应时代脉搏 。习近平总书记在纪念五四运动100周年大会上号召广大青年:“让青春在为祖国、为人民 、为民族、为人类的奉献中焕发出更加绚丽 的光彩。”面向未来 ,走好新时代的长征路 ,新时代青年要做强国栋梁,坚定理想信念、矢志拼搏奋斗。

  “敢担当”拓展奋斗光谱。激发新时代青年奋斗,要从“为谁而奋斗”中寻找答案。如果只讲个人奋斗,就会变成“精致的利己主义者”。精致利己 ,顾名思义即一切奋斗只 是为了达成自己的私利 。尽管实现每个人 的幸福 是人类奋斗的终极目 的,但个人 的幸福却无法仅凭只为自己 的奋斗达成 ,它倚赖每个人奋斗力量 的汇聚。翻开中国近代史,为何布满深重苦难 ?“四万万中国人,一盘散沙而已” 。中国共产党成立后,何以能在百年间使中国改天换地?因为它以民族复兴 的担当,引领并将全体人民 的奋斗组织了起来 。今天,我们比历史上任何时期都更接近 、更有信心和能力实现中华民族伟大复兴 的目标 ,但同时,我国改革发展稳定面临不少深层次矛盾躲不开、绕不过,国际形势严峻复杂,来自外部的打压遏制随时可能升级 。面对风高浪急甚至惊涛骇浪的重大考验 ,唯有担当起党和人民赋予的历史重任 ,方能在激扬青春、开拓人生、奉献社会 的进程中书写无愧于时代 的壮丽篇章。“敢担当”并非个人 的单向付出,而 是一种双向奔赴 。担当使个人与国家、时代产生命运与共 的联结 ,当一个人融入了一群人 ,一群人又会托举起一个人。

  “能吃苦”锤炼奋斗韧性 。激发新时代青年 ,要对“如何奋斗”做出解答。奋斗就要准备好与困难短兵相接,若意志力薄弱 、生性懒惰都难以克服 ,何谈战胜挫折 ?今天 ,不少人在奋斗之路上处于一种“仰卧起坐”的状态,在卷和躺之间反复横跳。如果“躺下 是为了更好地出发”,那么这样的躺下无可厚非。但如果演变为“遇挫即躺”的惯性,就会削弱韧劲 ,使原本不强 的意志更加脆弱。这样的青年 ,改变自己 的命运都不可能实现 ,遑论报效祖国 、担当民族复兴之大任 ?如何锤炼奋斗意志,增强面对困难时 的韧劲 ?没有谁生来就比别人意志更坚定 ,吃过苦才会不怕苦,克服困难一次 ,才会更有勇气迎战下一次。习近平总书记在河南安阳林州市红旗渠纪念馆考察时强调 ,年轻一代要继承和发扬吃苦耐劳 、自力更生、艰苦奋斗的精神 ,摒弃骄娇二气 ,像我们 的父辈一样把青春热血镌刻在历史 的丰碑上 。

  “青奋斗”吹响青春号角 。奋斗是艰辛 的 ,每一代青年的奋斗都不容易。今天的年轻人 ,并非不能吃苦。武汉疫情,新时代青年白衣为甲、逆行出征 。郑州暴雨,新时代青年筑起人肉防洪墙 ,与洪水较量 。北京冬奥,新时代青年顶着刺骨的冷在雪地轮班值守 。重庆山火,新时代青年在50度 的体感高温里运送物资。一旦青年心中 的使命感在关键时刻被唤醒 ,就会激发出冲锋 的勇气和豪情。但日常生活 、工作多数时刻平淡无奇,相比于豪情万丈的冲锋和突击 ,更需要久久为功坚守、默默耕耘奉献,更需要一个人 的毅力、耐力和定力 。

  今天,新时代青年 的人生之旅已经同国家 的复兴之路一起 ,铺展在实现第二个百年奋斗目标 的新征程中。习近平总书记在中国人民大学考察时强调 ,希望全国广大青年牢记党的教诲 ,立志民族复兴,不负韶华,不负时代,不负人民,在青春的赛道上奋力奔跑 ,争取跑出当代青年 的最好成绩 。面对前无古人的伟大事业 ,广大青年要以“有理想”远眺前路,以“敢担当”拓宽天地 ,以“能吃苦”披荆斩棘,在奋斗中与祖国同行,以有理想、敢担当、能吃苦 的奋斗 ,成就闪耀的青春 。

  (本文系北京市习近平新时代中国特色社会主义思想研究中心重大项目[19LLZD08]成果)

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